المجتمع المدني، التحول الديمقراطي، الاقتصاد السياسي، التطرف، العنف السياسي في الوطن العربي؛ الحركات الإسلامية المعاصرة؛ الشؤرن الخليجية

المنشورات

حسنين توفيق إبراهيم علي، النظم السياسية العربية: الاتجاهات الحديثة في دراستها (بيروت: مركز دراسات الوحدة العربية، 2005، 2008) 

فصول في كتب

- حسنين توفيق إبراهيم علي،" الحركات الإسلامية الراديكالية في مصر: الصعود والهبوط ،" في: كلدا مولاج (محرر)، الفاعلون المسلحون من غير الدول في السياسة العالمية (لندن: هيرست، 2010)

- حسنين توفيق إبراهيم علي،" الخليج في عام 2015/2016: خرائط التحديات والمبادرات والتحالفات،" في: د. حسنين توفيق إبراهيم علي (محرر)، الخليج في عام 2014- 2015 (جدة: مركز الخليج للأبحاث، ط1، 2016).